In Regensburg wohnt man an den Flüssen Donau, Naab und Regen. Weitere Bäche, beispielsweise der Aubach, durchfließen das Stadtgebiet. An Uferbereiche stehen alte Bäume, vor allem Weiden und Pappeln. Diese Bäume und die zugehörigen Uferbiotope stellen eine große Bereicherung dar und beherbergen eine große Artenvielfalt.
Neben zahlreichen Vogelarten, wie beispielsweise Weidenmeise, Fitis, Gelbspötter, Buntspecht, Kuckuck, Graureiher oder dem schillernden Eisvogel, gibt es hier auch Fledermäuse und viele Insekten - manche Käfer, die in den letzten Jahren entdeckt wurden, gibt es sonst nirgends mehr in Bayern. Und hier wohnt auch der Biber.