Ab 1986 wurden im Museum St. Ulrich die Kunstsammlungen des Bistums Regensburg präsentiert. Aufgrund von umfangreichen Restaurierungsmaßnahmen ist das Museum derzeit geschlossen, aber für Sonderaustellungen und Führungen geöffnet.

Gemälde, Skulpturen und Goldschmiedekunst führen im Museum St. Ulrich vom 11. ins 21. Jahrhundert – und bieten spannende Kontraste zwischen mittelalterlichen und zeitgenössischen Auseinandersetzungen der Künstler mit religiösen Motiven. Zu den besonderen Exponaten gehört das Gemälde „Schöne Maria“ von Albrecht Altdorfer.